Dalam rangka mengucap syukur atas rahmat pendampingan yang telah Allah limpahkan selama tahun pembelajaran 2012/2013 dan dalam rangka memohon berkat untuk perjalanan karya pelayanan pendidikan di tahun pembelajaran 2013/2014, karyawan unit Kantor Wilayah Yogyakarta bersama-sama mengadakan perayaan Ekaristi syukur. Perayaan Ekaristi dipimpin oleh Romo Ig. Prasetya H. Wicaksono, Pr. yang biasa dipanggil Romo Sony.

Libur akhir tahun pembelajaran sekolah 2012/2013 telah usai, kini saatnya para peserta didik menyambut tahun pembelajaran baru 2013/2014. Senin, 15 Juli 2013 hari pertama peserta didik masuk sekolah, dan sebagian dari mereka mengawali hari pertama sekolah di tempat yang baru. Bagi peserta didik baru, dua atau tiga hari pertama merupakan masa orientasi peserta didik baru (MOPDB), begitu juga peserta didik baru di sekolah-sekolah Tarakanita khususnya wilayah Yogyakarta.

Pada hari sabtu, 29 Juni 2013, bertempat di SMA Stella Duce 2 Yogyakarta, Jalan Dr. sutomo 16 Yogyakarta, telah dilaksanakan kegiatan serah terima tugas dan tanggungjawab pengelolaan unit-unit sekolah di Lingkungan Yayasan Tarakanita Kantor Wilayah Yogyakarta

Sebagai tindak lanjut implementasi CBHRM dan untuk pemetaan kompetensi karyawan, dilaksanakan UKG dikoordinir  oleh Kantor Pusat bekerja sama dengan Universitas Sanata Dharma.Pada hari Senin, 17 Juni 2013, bertempat di Unit SMA Stella Duce 2 Yogyakarta.

Yayasan Tarakanita Wilayah Yogyakarta menerima kunjungan Sosialisasi Bidang Hukum yang diselenggarakan pada hari Rabu, 29 Mei 2013 di Ruang Mensa Wisma Syantikara Jl. Colombo Yogyakarta. Ada dua hal yang menjadi fokus perhatian dalam pertemuan tersebut, berkaitan dengan Bidang Hukum.